蒙古人对岳飞极为敬重，将其尸体以棺木盛殓，派宋军降卒送至狄锋镇守的檀州，狄锋将岳飞隆重下葬，立庙祭祀，并将岳飞死讯飞报朝廷。

得知岳飞战死，宋朝人人震恐，赵构更是吓得魂不附体，不久传闻蒙古军绕开狄锋和韩世忠的防区正向中原内地进发，流亡的百姓也将“黑死病”传了过来，赵构匆匆下诏表彰了一下岳飞，赐谥“武穆”之后，便率领宫眷大臣们弃了东京开封南逃。不久“黑死病”果真在中原地区及东京城蔓延开来，造成了大批宋朝军民死亡。

此时蒙古军也饱受“黑死病”的折磨，开始北返，狄锋和韩世忠所镇守的地方军民也大批染病，不知为什么，狄锋和韩世忠也做出了和岳飞一样的事，以自己的血制药救治军民百姓，再以治好的人的血继续制药，医治别人，但这样的办法仍然不能制止疫病的蔓延，狄锋不久忧愤而死，韩世忠独力难支，听从部下的劝告，仅率千余未染病的将士突围南返，战斗中韩世忠身受重伤，双手仅余四指，回到东京开封后又被言官弹劾擅离职守，其麾下将士不服，杀死言官抛入河中，赵构闻讯将韩世忠免职，遣回原籍，不久韩世忠郁愤而亡。

瘟疫向中原内地扩散，横扫整个长江以北地区。瘟疫所到之处，到处都是死亡的人。根据当时文人的记录，“如果有人染上瘟疫而死，那么所有拜访过他、和他做过生意甚至把他抬到坟墓里的人很快都会步其后尘。”在东京开封，瘟疫传染的速度是如此之快，以至于装满尸体的车子像洪水一般涌向城外，日夜不息。而据另一位文士的记载，在太原城，情景同样恐怖：“因为这种恶疾是借助呼吸道传染的，故当人们交谈时，即从一人传染至另一人。所有病者皆感觉剧痛难忍，有的人浑身颤抖；结果臂部及股部皆会呈现脓疱，大如豆核，它们感染并贯穿至体内，至使病者猛烈吐血。此种可怖症状医治无效，持续三日后即告死亡。不仅与患者交谈可招致死亡，就是从病者那里买到、接触到、拿到任何东西，都能受传染而死”。

面对突如其来的瘟疫，人们无法解释，更无法治疗。为了寻求寄托，人们便纷纷来到寺院，期望得到仙佛神灵的保护和安慰。在和尚道士的带领下，他们一起祷告，祈求神佛阻止这种瘟疫的蔓延。但是他们的祈祷没有任何结果。相反，死者越来越多，人们日夜不停地掩埋着送来的死者。为了阻止瘟疫的扩散，死者的房子被封闭，没有人敢踏进它们一步。

在黑死病的袭击之下，整个宋朝陷入一片恐慌。人们发现任何人一旦染病，几乎没有可能康复，其传播速度极其迅猛，似乎一个人就足以传染全世界。惊恐之下，人们甚至把仍然活着的染病者的门和窗全部用木板钉起来，最终让他们在里面饿死。根据当时的各种文献记载：由于恐惧深入人心，兄弟姐妹之间、叔侄之间、夫妻之间互相抛弃，甚至更有甚者，父母丢弃孩子而不加照料。人们纷纷抛弃病人，丢掉家产，以期保全自己。还有些人正好相反。他们认为及时行乐有利于抵御黑死病。于是他们饮酒放歌，寻欢作乐，不分昼夜。有时他们也闯进别人的房子，寻找愉悦感官的刺激。由于当时许多人舍家弃产，他们的这种行为得到纵容。结果，许多房舍成了公共财产，这些人使用别人的物品，仿佛在使用自己的一样。官吏几乎消失，因为像其他人一样，他们非死即病，或干脆把自己和家庭封闭起来，疏于职守。不过情况最常见的是，大批人离弃他们的城市、家园、居所、亲戚、财产，只身逃到乡下。结果这种行为更进一步助长了瘟疫的蔓延。